张冲所带来的谈判方案是否都与蒋介石一一商量过，似颇可怀疑。因为，就在国共两党正准备就各项问题达成具体妥协之际，蒋介石却左思右想，“夜不能寐”。考虑到“目前最大问题为对共党之处置能否得当”，蒋明显地希望能够趁此时机一劳永逸地解决问题。由于对国民党来说，共产党最大的威胁在于其掌握着自己的军队，因此蒋考虑来考虑去，最终决定不惜拖延谈判，也要设法剥夺共产党的军事指挥权。用蒋自己的话来讲就是：“只可收编其部队，决不许其成立军部或总指挥部，但于其高级将领与编余人员，当尽量予以安置也。”
蒋介石的这种担心，实际上也是国民党许多人的担心。在周恩来将双方大体商妥的结果形成文字之后，顾祝同，特别是贺衷寒又特意做了更符合国民党人愿望的改动。在“中国共产党承认服从三民主义的国家及国民党在中国的领导地位，彻底取消暴动政策及没收地主土地政策，停止赤化运动，要求国民政府分批释放共产党，容许共产党在适当期内公开”一段中，将“要求”改为“请求”；在“取消苏维埃政府及其制度，现红军驻在地区改为陕甘宁行政区，执行中央统一法令与民选制度，其行政人员经民选推荐，请中央任命，其行政经费请由行政院及省政府规定之”一段中，将“现红军驻在地区改为陕甘宁行政区”改为“改编军队，指定现在之地区”，将“其行政人员经民选推荐，请中央任命”改为“其行政人员得由地方及中央任命”；将“红军取消，改编为国民革命军，服从中央军事委员会及蒋委员长之统一指挥，其编制、人员、给养、补充，统照国军同等待遇，其各级人员由自己推选，呈请军委会任命，政训工作由中央派人联络”一段，改为“取消红军，改编为国军三个师（编制如附表，一四二四人），服从军委会及蒋委员长一切命令”；将周特别列出的“改编现有红军中之最精壮者为三个国防师，计六旅十二团，步兵团及其他直属之工炮通信辎重等部队”、“在三个国防师之上，设某路军总指挥部，其直属队为特务营工兵营等”、“红军原有之骑兵三个团及一个骑兵连，共约一千四五百人马，拟编骑兵一个团”等等统统删去，增加了“各级军政人员第一步得由部队长保荐呈请军委会任命”、“各级副佐人员由中央改编后逐渐派遣”、“政工工作由中央召集原有政工人员加以训练，与新派人员一同回部队工作”、“现有骑兵改编问题及设指挥部一节，候请示后再定”等内容。贺衷寒还在最后特别增加了一段文字，即“各事接洽妥善，望将中国只能实行三民主义而不能实行共产主义之真谛宣告国人”。